本片講述的是蝙蝠俠（羅杰·克雷格·史密斯 配音）以及羅賓聯合正義聯盟成員閃電俠以及綠箭俠一起對抗被稱為Animilitia的犯罪組織。該犯罪組織都是由一些動物性的成員組成，包括銀背大猩猩、獵豹女、殺手鱷魚等，他們在高譚市作惡多端，一般警察對他們束手無策。而且該組織背后的主謀卻指向蝙蝠俠的宿敵，同時也是高譚市叱吒風云的黑道大亨企鵝人（Dana Snyder 配音）。除了Animilitia組織，蝙蝠俠他們這次還要面對奧斯【sī】瓦德公司的商人新發明的邪惡網絡動物機器人，一群犯罪惡勢力再次聚集在高譚市。