450年前，企圖稱霸宇宙的哈迪斯【sī】大帝戰敗而被幻神星人娜倫用史特拉石碑陣封印。 450年后的現代，為了復活哈迪斯，其手下佐拉博士派遣機動騎士與宇宙巨獸攻擊地球。幸運的是，在此同時，幻星神獸雷零守亦因此蘇醒，而原來平凡的高中生伊達翔太、真田由加以及就讀京南大學的平賀真也，受到召喚化身成為幻星神戰士，負責保護地球這一神圣使命。