寧靜的小鎮村住著一位神秘的尤教授，他通過科【kē】學實驗創造出了三個擁有超級力量的完美女孩，她們的名字分別是：泡泡、毛毛和花花。泡泡的性格在三人之中最為天真開朗，毛毛的性格在三人之中較為暴躁易怒，花花則是天生的領袖和代言人，她們三個人互相幫助，補足對方的不足，組成了以懲奸除惡為終極使命的“飛天小女警”組合。在小鎮村內設有專線供村民們呼叫飛天小女警前往幫助他們，小女警們的首要任務就是與各方反派勢力斗智斗勇。三位超能小女警需要在小鎮需要她們的時候出動，打擊罪犯，用自己無與倫比的“女孩力量”守護家園和身邊的小鎮居民們。在本季中，小女警們將花費一整天的時間探索尤教授的實驗室，并發現里面其實有令她們意想不到的秘密。