變形聯盟和海澄合力擊敗敵人，平溪市再次回歸和平。然而時空能量異常波動情況卻愈演愈烈，導致現【xiàn】實世界與平行宇宙發生交錯產生了時空歧點，時空獸也隨之出現。就在變形聯盟忙于對付時空獸修復時空歧點時，茜卡與雙子星匯合，策劃了一系列針對變形聯盟和平溪市的侵襲行動，也趁亂奪走沉睡在基地中的蟲王卵。阻止時空錯亂，抵抗浩肯星侵襲，面對雙重壓力和危機，變形聯盟和海澄毫不退縮。但在一連串的強攻之下眾人逐漸失去自我，在海澄的幫助下恢復斗志，最終一起擊敗強大敵人，守護了時空秩序與地球和平。