Season2では、吉宗の遺志を継ぎ若き醫師たちが赤面皰瘡撲【pū】滅に向けて立ち上がったその後の物語から、幕府の人々が江戸城無血開城のために奔走した幕末?大政奉還までが初めて映像化される。